消化系统出问题几乎是每个豚鼠或者啮齿动物主人一定会遇到的，可能是由感染和饮食不当引起的，其中的一些疾病也非常的致命，必须引起宠物主人的重视。
许多种类的细菌、病毒、寄生虫都会干扰豚鼠的消化系统，消化系统紊乱的表现还包括腹泻、体重减轻、精神萎靡和脱水。受到疾病影响豚鼠可能会看起来没有生病的情况下突然死亡，如果出现症状，可能表现为毛发粗糙、肛门周围有粪便污染，腹泻拉稀、弓后背、呼吸急促、脱水、眼神呆滞、脱水，腹部疼痛，初期发烧，后期体温过低。
最常见的原因是吃了变质食物引起细菌感染的肠炎，吃水含量过高的水果蔬菜，用药导致肠内菌落失调，以及一些食物不耐受；对于不严重的腹泻，增加粗粮并且减少谷物和糖分可能对腹泻有治疗效果，吃粗粮会增加膳食纤维，除了商业豚鼠粮食之外，还需要提供充足的干草。额外补充益生菌（小宠物益生菌）可能有助于恢复消化道理的菌落平衡。
腹泻期间补充充足的饮水非常重要，多数豚鼠并不会主动喝足够的水，而是通过蔬菜水果摄入水分，因为腹泻期间减少了蔬菜水果的食用，所以会导致饮水不足，需要宠物主人额外喂水甚至点滴补充额外的液体。只有在必须的情况下才会使用抗生素，上篇文章我们说了，大多数抗生素会导致它中毒，并且会加剧消化道里的菌落不平衡。
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豚鼠也是啮齿动物，牙齿一辈子不断生长，这导致会出现一些别的宠物少见的牙齿口腔疾病。每当豚鼠咀嚼喝吞咽出现问题的时候，它们就会流口水，通常原因是牙齿生长不当，也可以叫咬合不正。咬合不正可能是遗传导致的，也可能是因为缺乏维生素C，受伤或者饮食里某种矿物质成分不平衡导致的。因为牙齿每天都在生长，所以如果牙齿或者上下颌不能正确咬合，牙齿可能会因为过度生长，使得宠物难以咀嚼，随后出现体重减轻、口腔出血或者牙龈脓肿，随后还会引起鼻窦感染。
因为口腔疾病在豚鼠身上非常常见，所以如果您的豚鼠出现流口水，您需要仔细检查门牙和后面的臼齿，是否有出现过长和变形，门牙过长可以通过定期剪牙来避免，臼齿的修护非常的困难。2个月前有一只仓鼠，后臼齿长期没有磨损，导致臼齿生长过长，从上面脸颊部位穿刺出来，导致嘴张开困难。为了避免后臼齿不磨损，所以需要日常给它们准备各种不同的磨齿食物，每只豚鼠可能会有不同的爱好味道和啃咬习惯，所以经常听到宠物主人抱怨，它们不吃磨牙棒，其实很可能是形状和口味它们咬的不舒服，遇到这种情况建议多买各种形状和口味的磨牙棒来尝试。
如果发现豚鼠的嘴已经无法闭合，无法咀嚼食物，建议您立刻咨询您的宠物医生，做适当的检查确定问题的根源。豚鼠的代谢非常快，所以不能过长时间不吃饭，否则会导致低血糖甚至死亡。
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