沼泽龟是一种中等大小的黑色淡水龟。沼泽龟可通过幼体背甲上的3条脊棱（虽然成体只有1条脊棱）同婆罗洲的其他龟类相区别。背甲的后部还有锯齿状边缘，成体的椎盾区域是扁平的。成年雄性可通过相对更长更粗的尾部来辨别，且腹甲稍显凹陷。除此之外，成年雌性保留有浅色的头部斑点，而雄性的这些斑点会随着生长逐渐褪去。
沼泽龟换壳是一种正常的生理现象，就像人类长大一样，需要脱去旧的衣服来适应新的生长阶段。换壳是沼泽龟成长的标志之一，通常在春季或夏季进行。在换壳期间，沼泽龟的背壳和腹壳上的角质会逐渐脱落，露出新的骨骼。
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