蜜蜂巢的作用有很多的，一般是有增强免疫、抗炎杀菌、降压降脂等；有攻毒杀虫、祛风止痛的功效。蜂巢中含有多种酶和矿物质，经协同作用后可提高人体免疫力。同时，蜂巢中所含的脂肪酸、有机酸等成分能增强免疫系统，增强免疫细胞的活性，调节机体的特异性和非特异性免疫功能。蜂巢最重要的作用之一就是杀菌抗炎。
还有蜂巢对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、痢疾杆菌、伤寒杆菌和变形杆菌有较强的抗菌作用，对烟曲霉、黄曲霉、茄枯镰刀菌和明串珠菌也有抑制作用。蜂巢中所含的黄酮类、不饱和脂肪酸和矿物质能显著降低血液中甘油三酯和胆固醇的含量，增强血管弹性，使蜂巢显示出显著的降脂降压效果。