使用透气的笼子
在边境牧羊犬的室内训练中，笼子是必不可少的。然而，我们不能把边牧终身关在笼子里，它们也需要一个舒适的休息场所。在室内训练的前两周，我们可以限制边牧在笼子内的自由，但之后它们应该可以在屋内自由行动。我们可以在笼子里喂食狗，然后在合适的时间带它们出去排便。排便后，再把它们关回笼子，并给予玩具和毛毯，直到下一次排便时间到来。对于幼狗来说，这个时间间隔不能超过2小时，对于成年狗来说，不能超过4个小时。
边牧不喜欢在它们玩耍和睡觉的区域排便，所以笼子应该有足够的空间让它们站立和转身，但又不能太大，以免让它们在笼子一侧排便。当边牧的室内训练完成后，我们可以让笼子的门一直开着，这将成为它们放松和休息的好地方。
报纸训练
如果你住在公寓里，无法方便地带边牧到户外排便，那我们可以尝试进行”报纸训练”。方法是，在一个相对封闭的空间，如厨房或卫生间地板上铺满报纸。当边牧在报纸上排便后，我们需要及时更换脏的报纸。几天后，可以拿走部分报纸，使地面裸露出一小部分。如果边牧在裸露的地面上排便，我们可以轻柔地纠正它，并把它放回报纸上，然后称赞它。当边牧对在报纸上排便有一定概念后，我们可以逐渐取走更多的报纸，直到最后只留下一个小块地方供它排便。
外出训练
尽量多地带边牧幼犬外出。小狗需要经常排便，特别是在进食后的15至20分钟内。随着它们的成长，这个时间可能会延长。当我们观察到边牧表现出排便的迹象，如轻声哀鸣或在原地转圈时，我们要迅速抱起它们并带到户外。当它们在外面完成排便后，立刻对它们的行为进行夸奖，并使用我们喜欢的词语(最好固定一个词)。然后再带它们回家前陪它们玩一会儿。边牧小狗会逐渐明白，在户外排便可以得到夸奖和在户外玩耍的机会。
通过充分透气的笼子、报纸训练以及外出训练，我们可以帮助边牧建立正确的排便习惯，并逐渐使它们适应室内训练和户外活动。这些方法需要我们耐心和坚持，但最终会带来训练成果。