猫呼吸时发出咕噜咕噜的声音有多种原因：
1、感到舒适和放松：当猫感到舒适、满意、愉悦的时候，会发出呼噜呼噜的声音。这通常发生在猫咪被主人亲昵、睡在主人身边或进食时。这种声音是由咽喉部的震动导致的，属于正常现象，一般不需要额外治疗。
2、自我安慰：在面对不安全感或者紧张时，猫也会发出呼噜呼噜的声音，以帮助调节自己的情绪，达到自我安慰的效果。
3、病理性原因：呼噜声也可能是由于呼吸道感染、咽炎、喉炎等病理性原因导致的。这些情况下，呼噜声通常伴随咳嗽、打喷嚏、流鼻涕等症状。需要及时带猫咪去宠物医院做进一步检查和治疗。