水母的先祖可以追溯到更为原始的腔肠动物。腔肠动物是一类结构简单的多细胞动物，它们的中胚层不发达，如水螅类甚至只有三层细胞。科学家们在中国云南省的寒武纪化石中发现了现代水母的古代祖先，被称为“云滇水母祖先”或“甘克特里亚·阿斯帕拉”(Gangtoucunia aspera)。这些化石揭示了约5.14亿年前在寒武纪海底生活的管状生物，这些生物具有钙增强的“骨架”管，这可能是一种有效的生存策略。
需要注意的是，这里提到的“先祖”或“祖先”是基于生物演化和化石记录的研究结果，而不是直接的生物谱系关系。此外，生物演化是一个复杂的过程，涉及到许多中间形态和分支，因此可能存在多种不同的观点和解释。